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生物化學總結酶

時間:2023-11-06 22:00:07 生物/化工/環(huán)保/能源 我要投稿
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生物化學總結酶

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生物化學總結酶

  酶的概論

  1.定義:具有高效性與特異性的生物催化劑。

  2.酶作為生物催化劑的特點:

  a.酶具有很高的催化效率。

  b.酶具有高度專一性。

  c.酶易失活。

  d.酶活性受到調(diào)節(jié)和控制。

  3.酶作用專一性的機制與假說:鎖鑰學說、誘導契合學說。

  4.酶的化學組成:

  5.酶的命名:反應物:反應物+反應類型+酶。

  6.六大酶類:

  酶的催化原理

  1.酶通過降低反應的活化能,從而使反應速率增大。

  2.酶與底物復合物的形成:

  3.酶的活性部位:蛋白質(zhì)的結構決定功能,酶活性部位的結構特點決定酶行使其催化功能的特點(高效性、專一性);钚圆课皇敲附Y合和催化底物反應的場所,是酶分子表面的一小部分區(qū)域,其功能基團包含催化基團與結合基團。

  特點:

  a.活性部位在酶分子整個體積中只占很小的一部分。

  b.酶的活性部位具有三維立體結構。

  c.酶的活性部位是酶分子上的一個裂隙。

  d.活性部位具有與底物相對互補的結構,酶活性部位具有柔性,可發(fā)生誘導契合。

  e.底物通過非共價作用結合到酶分子上。

  f.活性部位對酶的整體構象具有依賴性。

  4.影響酶催化效率的因素:(改變反應途徑降低活化能)

  非共價作用:鄰近效應與定向效應、底物的形變與誘導契合(←過渡態(tài)理論)。

  共價作用:酸堿催化、共價催化、金屬離子催化。

  (1).鄰近效應:酶與底物結合以后,使原來游離的底物集中于酶的活性部位,從而減小底物之間或底物與酶的催化基團之間的距離,提高底物有效濃度,使反應更容易進行,增加反應速率的一種效應。定向效應:反應物的反應基團之間、以及酶的催化基團與底物的反應基團之間的正確定位和取向產(chǎn)生的效應。

  (2).當酶與底物結合后,酶與底物之間的非共價作用可以使底物分子圍繞其敏感鍵發(fā)生形變,從而促進底物過渡態(tài)的形成,反應活化能被降低,反應速率得以加快。酶與底物結合時,在底物發(fā)生形變的同時,酶活性部位的構象也在底物的影響作用下發(fā)生改變,二者的形變導致酶與底物更好地結合,形成一個互相契合的酶-底物復合物。

  (3).結合能與過渡態(tài)理論:結合能來自酶與底物之間的非共價作用。結合能被用于降低活化能。酶與底物過渡態(tài)之間產(chǎn)生最多最適的非共價作用,釋放最多結合能。與酶經(jīng)誘導契合調(diào)整后的構象最匹配的是底物經(jīng)形變產(chǎn)生的過渡態(tài),酶與底物過渡態(tài)的親和力要大于酶與底物或產(chǎn)物的親和力。過渡態(tài)理論的證明(如抗體酶、競爭性抑制劑)。

  (4).酸堿催化:通過向反應物提供質(zhì)子或從反應物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài),加速反應的一類催化機制.

  共價催化:催化劑通過與底物形成不穩(wěn)定的共價中間復合物,降低反應活化能,從而提高反應速度的機制。金屬離子催化:通過結合底物為反應定向,電荷屏蔽與穩(wěn)定作用,在氧化還原反應中起傳遞電子作用。

  5.酶具有高催化效率的分子機理是:酶分子的活性部位結合底物形成酶-底物復合物,在酶的幫助作用下(包括共價作用與非共價作用),底物進入特定的過渡態(tài),由于形成此類過渡態(tài)所需要的活化能遠小于非酶促反應所需要的活化能,因而反應能夠快速、順利地進行,形成產(chǎn)物并釋放出游離的酶,使其能夠參與其余底物的反應。一種酶的催化作用常常是多種催化機制的綜合作用。酶的活性部位一般都含有多個與酶催化作用相關的基團,可以通過協(xié)同作用。

  6.胰凝乳蛋白酶催化反應機制:催化三聯(lián)體,共價催化+酸堿催化。

  酶促反應動力學

  在酶催化的反應中,酶先與底物形成酶-底物中間復合物。當?shù)孜锓肿釉诿缸饔孟掳l(fā)生化學變化后,中間復合物再分解成產(chǎn)物和酶。

  1.米氏常數(shù)Km的意義:米氏常數(shù)是反應速度為最大值的一半時的底物濃度,大小只與酶的性質(zhì)有關,與酶的濃度無關;不同的酶具有不同Km值。Km值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Km值。

  1/Km值可用于近似地表示酶與底物之間的親和程度:1/Km值大表示親和程度大;1/Km值小表示親和程度小。Km值可用于計算酶促反應初速率v,

  在一定酶濃度下,Vmax是常數(shù);Vmax值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Vmax值。

  2.kcat的意義:kcat表示當酶被底物飽和時每秒鐘每個酶分子轉換底物的分子數(shù),稱為轉換數(shù)(TN)或催化常數(shù)。kcat通常等于多步反應中單一限度步驟的反應速率常數(shù),例如kcat可等于經(jīng)典米氏動力學反應過程的k3。kcat值越大,表示酶的催化效率越高。

  生理條件下,[S]?Km時,kcat/Km的值可以作為酶促反應速率大小的衡量。kcat/Km可用于綜合反映酶的催化能力。

  3.影響酶促反應速率的因素:

  酶的抑制作用:改變酶的必需基團的化學性質(zhì),引起酶活力降低或喪失的作用。

  a.不可逆的抑制作用:抑制劑與酶的必需基團通常以共價鍵結合,引起酶的永久性失活。

  b.可逆的抑制作用:抑制劑與酶蛋白以非共價鍵結合,引起酶活性暫時性喪失。抑制劑可以通過透析、超濾等物理方法被除去,并且能部分或全部恢復酶的活性。分為:競爭性抑制、非競爭性抑制、反競爭性抑制。

  酶的調(diào)控

  1.方式:改變酶的數(shù)量與分布(同工酶),改變酶個體的活性(改變酶的結構、直接干涉酶與底物的相互作用)。

  2.通過改變酶結構調(diào)控酶活性:別構調(diào)控、可逆的共價修飾、酶原激活(蛋白激酶A的激活、表皮生長因子受體的激活)。

  3.別構調(diào)控:許多酶除具有活性部位外,還具有調(diào)節(jié)部位,酶的調(diào)節(jié)部位可以與某些化合物可逆地非共價結合,使酶發(fā)生構象的改變,進而改變酶的催化活性,這種酶活性的調(diào)節(jié)方式稱為酶的別構調(diào)控。別構調(diào)控可分為同促別構調(diào)控與異促別構調(diào)控,同促別構調(diào)控中,酶的活性部位和調(diào)節(jié)部位是相同的,效應物是底物;異促別構調(diào)控中,酶的活性部位和調(diào)節(jié)部位是不同的,效應物是非底物分子。

  同促別構調(diào)控:底物分子本身對別構酶的調(diào)節(jié)作用。別構酶底物濃度對反應速率的動力學曲線不是雙曲線,是S形曲線。

  異促別構調(diào)控:非底物分子的調(diào)節(jié)物對別構酶的調(diào)節(jié)作用。

  4.酶別構調(diào)控的一般機理:別構酶的結構基礎-寡聚酶結構。酶的某個活性部位結合底物后,構象改變的信息在酶分子中進行傳遞,最終產(chǎn)生效應,影響酶的總活性狀態(tài)。多肽鏈之間的界面作為分子開關起關鍵作用。非底物效應物通過與非活性部位(調(diào)節(jié)部位)結合,引起酶構象的變化,最終影響酶的總活性狀態(tài)。

  5.酶別構調(diào)控的意義:在酶水平對代謝進行調(diào)節(jié),反饋抑制。

  6.可逆的共價修飾:由其它的酶對共價調(diào)節(jié)酶進行可逆共價修飾,使其在活性形式和非活性形式之間相互轉變,從而調(diào)節(jié)酶活性。蛋白質(zhì)的磷酸化是一種重要的可逆的共價修飾形式,指由蛋白激酶催化的把ATP或GTP位磷酸基轉移到底物蛋白質(zhì)氨基酸殘基上的過程,其逆過程是由蛋白磷酸酶催化的水解反應,稱為蛋白質(zhì)的脫磷酸化。在信號傳遞體系中,通過各級蛋白激酶介導的激活反應,構成了級聯(lián)式放大反應的主體。

  7.酶原的激活:在蛋白酶的專一作用下,酶原結構發(fā)生改變,形成酶的活性部位,變成有活力的酶的活化過程。

  酶原:在生物體內(nèi)被合成的,不具有催化活性的酶的前體。

  8.許多酶的調(diào)控作用是各種調(diào)控作用的組合。

  分類方式

  人體和哺乳動物體內(nèi)含有至少5000種酶。它們或是溶解于細胞質(zhì)中,或是與各種膜結構結合在一起,或是位于細胞內(nèi)其他結構的特定位置上,只有在被需要時才被激活,這些酶統(tǒng)稱胞內(nèi)酶;另外,還有一些在細胞內(nèi)合成后再分泌至細胞外的酶──胞外酶。

  按反應性質(zhì)

  根據(jù)酶所催化的反應性質(zhì)的不同,將酶分成七大類:

  氧化還原酶類(oxidoreductase)促進底物進行氧化還原反應的酶類,是一類催化氧化還原反應的酶,可分為氧化酶和還原酶兩類。

  轉移酶類(transferases)催化底物之間進行某些基團(如乙;⒓谆、氨基、磷酸基等)的轉移或交換的酶類。例如,甲基轉移酶、氨基轉移酶、乙酰轉移酶、轉硫酶、激酶和多聚酶等。

  水解酶類(hydrolases )催化底物發(fā)生水解反應的酶類。例如,淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、磷酸酶、糖苷酶等。

  裂合酶類(lyases)催化從底物(非水解)移去一個基團并留下雙鍵的反應或其逆反應的酶類。例如,脫水酶、脫羧酶、碳酸酐酶、醛縮酶、檸檬酸合酶等。許多裂合酶催化逆反應,使兩底物間形成新化學鍵并消除一個底物的雙鍵。合酶便屬于此類。

  異構酶類(isomerases)催化各種同分異構體、幾何異構體或光學異構體之間相互轉化的酶類。例如,異構酶、表構酶、消旋酶等。

  合成酶類(ligase)催化兩分子底物合成為一分子化合物,同時偶聯(lián)有ATP的磷酸鍵斷裂釋能的酶類。例如,谷氨酰胺合成酶、DNA連接酶、氨基酸:tRNA連接酶以及依賴生物素的羧化酶等。

  易位酶類(translocase)催化離子或分子跨膜轉運或在膜內(nèi)移動的酶類。其中有些涉及ATP水解反應的酶被歸為水解酶類(EC 3.6.3-),但水解反應并非這類酶的主要功能。因此,命名委員會近期決定將這類酶歸為第七大類酶。

  按照國際生化協(xié)會公布的酶的統(tǒng)一分類原則,在上述七大類基礎上,在每一大類酶中又根據(jù)底物中被作用的基團或鍵的特點,分為若干亞類;為了更精確地表明底物或反應物的性質(zhì),每一個亞類再分為幾個組(亞亞類);每個組中直接包含若干個酶。

  按化學組成

  單純蛋白質(zhì)

  屬于單純蛋白質(zhì)的酶類,除了蛋白質(zhì)外,不含其他物質(zhì),如脲酶、蛋白酶、淀粉酶、脂肪酶和核糖核酸酶等

  綴合蛋白質(zhì)

  屬于綴合蛋白質(zhì)的酶類,除了蛋白質(zhì)外,還要結合一些對熱穩(wěn)定的非蛋白質(zhì)小分子物質(zhì)或金屬離子,前者稱為脫輔酶,后者稱為輔因子,脫輔酶與輔因子結合后所形成的復合物稱為全酶,即全酶=脫輔酶+輔因子。

  反應特點

  1 高效性:酶的催化效率比無機催化劑更高,使得反應速率更快;

  2專一性:一種酶只能催化一種或一類底物,如蛋白酶只能催化蛋白質(zhì)水解成多肽;

  3 多樣性:酶的種類很多,迄今為止已發(fā)現(xiàn)約4000多種酶,在生物體中的酶遠遠大于這個數(shù)量;

  4 溫和性:是指酶所催化的化學反應一般是在較溫和的條件下進行的;

  5 活性可調(diào)節(jié)性:包括抑制劑和激活劑調(diào)節(jié)、反饋抑制調(diào)節(jié)、共價修飾調(diào)節(jié)和變構調(diào)節(jié)等;

  6 易變性:大多數(shù)酶是蛋白質(zhì),因而會被高溫、強酸、強堿等破壞;

  7 有些酶的催化性與輔助因子有關;

  8 改變化學反應速率,本身幾乎不被消耗;

  9 只催化已存在的化學反應;

  10 能加快化學反應的速度,但酶不能改變化學反應的平衡點,也就是說酶在促進正向反應的同時也以相同的比例促進逆向的反應,所以酶的作用是縮短了到達平衡所需的時間,但平衡常數(shù)不變;

  11 降低活化能,使化學反應速率加快;

  12 與無機催化劑一樣,也會出現(xiàn)中毒現(xiàn)象。

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