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中科院微生物研究所微生物資源中心的詳細(xì)介紹
中國(guó)科學(xué)院微生物研究所微生物資源中心(IMCAS-BRC)是在中國(guó)普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)和微生物所信息中心的微生物資源信息數(shù)據(jù)庫(kù)與共享平臺(tái)基礎(chǔ)上,通過(guò)設(shè)立微生物功能評(píng)價(jià)部門,并完善質(zhì)量保證系統(tǒng)而組建的公益性機(jī)構(gòu)。它在CGMCC的微生物物種保藏基礎(chǔ)上,重點(diǎn)加強(qiáng)了微生物資源深度開(kāi)發(fā)利用的研究以及資源質(zhì)量保證及其共享的標(biāo)準(zhǔn)體系。
IMCAS-BRC以科學(xué)家為主導(dǎo),以技術(shù)人員為主體,依托微生物資源前期開(kāi)發(fā)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和中國(guó)科學(xué)院真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的研究?jī)?yōu)勢(shì),將注重認(rèn)識(shí)并開(kāi)發(fā)利用微生物資源的功能;同時(shí),以“整合資源、認(rèn)識(shí)功能、開(kāi)放共享、服務(wù)社會(huì)”為建設(shè)原則,IMCAS-BRC將對(duì)科研、教學(xué)及產(chǎn)業(yè)部門提供資源和技術(shù)服務(wù),并與國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)、產(chǎn)業(yè)實(shí)體開(kāi)展合作研發(fā)。
基于完善的信息數(shù)據(jù)系統(tǒng),IMCAS-BRC與國(guó)際上多個(gè)微生物資源中心(BRC)合作共享資源信息,共建地區(qū)、乃至全球的BRC網(wǎng)絡(luò);同時(shí)按照經(jīng)濟(jì)合作與發(fā)展組織(OECD)的BRC標(biāo)準(zhǔn),進(jìn)一步完善資源管理體系和質(zhì)量保證系統(tǒng)。
微生物資源前期開(kāi)發(fā)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任東秀珠研究員擔(dān)任IMCAS-BRC主任。IMCAS-BRC下設(shè)4個(gè)部門:保藏部、功能評(píng)價(jià)部、信息部和質(zhì)量保證辦公室。保藏部主任為中國(guó)普通微生物菌種保藏管理中心主任周宇光;功能評(píng)價(jià)部主任為中國(guó)科學(xué)院真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究員車永勝;信息部主任為微生物研究所信息中心主任馬俊才;質(zhì)量保證辦公室主任為微生物研究所工業(yè)微生物與生物技術(shù)研究室研究員張立新。
1.微生物資源中心保藏部
微生物資源中心保藏部(以下簡(jiǎn)稱保藏部)以中國(guó)普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)為基礎(chǔ)組建,宗旨是廣泛收集保藏各類微生物菌株、細(xì)胞株和基因,為微生物資源的保護(hù)、共享和持續(xù)利用提供服務(wù)和支持。
CGMCC成立于1979年,是提供專業(yè)技術(shù)服務(wù)的公益性機(jī)構(gòu)。作為國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局指定的專利微生物保藏中心,1995年被世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織批準(zhǔn)具有布達(dá)佩斯條約國(guó)際保藏單位資質(zhì)。保藏部建有菌種庫(kù)、細(xì)胞庫(kù)和基因庫(kù)。目前保藏各類微生物菌種4000余種、35000余株(其中用于專利程序的培養(yǎng)物3200余株),并建有熱泉和牦牛瘤胃微生物群落元基因組BAC文庫(kù)和質(zhì)粒文庫(kù)(庫(kù)容量達(dá)76000個(gè)克隆、DNA插入片段達(dá)418 Mbp)。
保藏部設(shè)有高通量培養(yǎng)技術(shù)組、環(huán)境基因資源技術(shù)組、細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)組及快速準(zhǔn)確鑒定技術(shù)組。技術(shù)人員目前正在建立一系列技術(shù)平臺(tái),包括難培養(yǎng)和特殊環(huán)境微生物的高通量培養(yǎng)和保藏技術(shù)平臺(tái),環(huán)境基因組文庫(kù)建立和保藏技術(shù)平臺(tái),及準(zhǔn)確快速物種鑒定技術(shù)平臺(tái)等。這些技術(shù)平臺(tái)的建設(shè)目標(biāo)是獲得特殊類群和特殊功能的微生物培養(yǎng)物及其功能基因,為微生物功能的利用貯備具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的資源。
保藏部對(duì)科研、教學(xué)和政府部門提供各類微生物菌種和細(xì)胞株,保存用于專利程序的各種可培養(yǎng)生物材料,鑒定微生物菌種,并提供與微生物資源相關(guān)的技術(shù)咨詢和情報(bào)服務(wù)。CGMCC還與國(guó)內(nèi)外微生物保藏及研究機(jī)構(gòu)保持著密切聯(lián)系。
2.微生物資源中心功能評(píng)價(jià)部
微生物資源中心功能評(píng)價(jià)部(以下簡(jiǎn)稱功能評(píng)價(jià)部)以中國(guó)普通微生物菌種保藏管理中心(CGMCC)、微生物資源前期開(kāi)發(fā)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)科學(xué)院真菌地衣系統(tǒng)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的研究力量與菌種資源為依托,建立微生物功能活性物質(zhì)的高通量篩選技術(shù)體系和評(píng)價(jià)系統(tǒng);利用該技術(shù)體系發(fā)現(xiàn)與人類生活和健康密切相關(guān)的微生物代謝產(chǎn)物,最終形成一個(gè)開(kāi)放共享的生理活性及功能物質(zhì)的發(fā)現(xiàn)與評(píng)價(jià)技術(shù)平臺(tái)。
功能評(píng)價(jià)部主要開(kāi)展小分子化合物和蛋白質(zhì)(酶)的篩選與評(píng)價(jià)。以重要疾病包括傳染病、腫瘤等為靶標(biāo),建立小分子化合物高通量篩選模型及方法;以工業(yè)發(fā)展和人類生活的需求為出發(fā)點(diǎn),建立高通量酶活篩選模型與方法,包括糖苷酶、蛋白酶、脂肪酶及其它重要工業(yè)用酶等。目的是促進(jìn)微生物資源的可持續(xù)利用。
功能評(píng)價(jià)部還將建立蛋白質(zhì)高效表達(dá)技術(shù)平臺(tái),包括數(shù)種原核和真核生物表達(dá)系統(tǒng),尤其是可同時(shí)表達(dá)數(shù)個(gè)基因的絲狀真菌/放線菌表達(dá)系統(tǒng), 用于元基因組文庫(kù)中功能基因的表達(dá)。
功能評(píng)價(jià)部建有微生物次生代謝產(chǎn)物(粗提物)、部分純化(餾分)以及純化合物的樣品庫(kù),同時(shí)建立了部分篩選模型與評(píng)價(jià)方法。本部將不斷擴(kuò)充樣品庫(kù)的庫(kù)容量,建立和引進(jìn)多個(gè)篩選模型,拓展功能篩選和評(píng)價(jià),并對(duì)外開(kāi)放,積極開(kāi)展與研究及產(chǎn)業(yè)部門的合作。
3. 微生物資源中心信息部
微生物資源中心信息部(以下簡(jiǎn)稱信息部)設(shè)立于微生物研究所的信息中心,致力于建設(shè)微生物資源信息管理平臺(tái)、建立數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)與數(shù)據(jù)規(guī)范、開(kāi)發(fā)微生物資源數(shù)據(jù)庫(kù)和建設(shè)對(duì)外信息共享門戶。
信息部作為中國(guó)科學(xué)院典型培養(yǎng)物委員會(huì)信息中心、亞洲微生物資源保藏與可持續(xù)利用協(xié)會(huì)中國(guó)節(jié)點(diǎn)、國(guó)際生物鏡像網(wǎng)中國(guó)國(guó)家節(jié)點(diǎn)、Global BRC Network成員單位,長(zhǎng)期以來(lái)致力于我國(guó)微生物資源的信息化,目前已經(jīng)建立了微生物菌種信息數(shù)據(jù)庫(kù)、物種生理生化性狀數(shù)據(jù)庫(kù)、核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)、菌種銷售數(shù)據(jù)庫(kù)、客戶管理數(shù)據(jù)庫(kù)、中國(guó)科學(xué)院典型培養(yǎng)物數(shù)據(jù)庫(kù)、亞洲微生物資源目錄數(shù)據(jù)庫(kù),并建立了我國(guó)微生物學(xué)領(lǐng)域最大的信息共享網(wǎng),可共享數(shù)據(jù)資源超過(guò)1TB。信息部開(kāi)發(fā)的微生物資源管理系統(tǒng),已被我國(guó)多家微生物資源保藏中心使用,并作為亞洲微生物資源網(wǎng)的信息門戶平臺(tái)。
目前,信息部會(huì)同保藏部和質(zhì)量保證辦公室,在維護(hù)和更新現(xiàn)有各數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)的基礎(chǔ)上,正在建立高通量篩選數(shù)據(jù)庫(kù)、指紋圖譜/分子標(biāo)識(shí)數(shù)據(jù)庫(kù)、微生物條形碼庫(kù)、微生物志數(shù)據(jù)庫(kù)和生物信息數(shù)據(jù)庫(kù)。此外,信息部正在開(kāi)發(fā)微生物資源專用檢索引擎和生物信息學(xué)超級(jí)計(jì)算平臺(tái)。
4. 微生物資源中心質(zhì)量保證辦公室
微生物資源中心質(zhì)量保證辦公室負(fù)責(zé)中心的微生物資源和技術(shù)服務(wù)質(zhì)量管理、知識(shí)產(chǎn)權(quán)管理和生物安全管理,以及中心的宣傳等工作。目標(biāo)是通過(guò)規(guī)范化管理,達(dá)到保證技術(shù)服務(wù)質(zhì)量、保護(hù)知識(shí)產(chǎn)權(quán)、杜絕安全事故的目的。
質(zhì)量保證辦公室的職責(zé)包括如下三方面:
1.中心的資源及技術(shù)服務(wù)的質(zhì)量保證工作:制定并組織建設(shè)中心的質(zhì)量管理體系,編制管理文件,組織內(nèi)部審核等;組織實(shí)施實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可、計(jì)量認(rèn)證工作,聯(lián)絡(luò)評(píng)審機(jī)構(gòu);組織實(shí)施質(zhì)量體系培訓(xùn)計(jì)劃和能力驗(yàn)證等質(zhì)量控制工作;協(xié)助工作委員會(huì)評(píng)估中心各部門的年度質(zhì)量報(bào)告。
2.知識(shí)產(chǎn)權(quán)管理工作:制訂中心微生物資源相關(guān)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)工作規(guī)劃和計(jì)劃;執(zhí)行國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局和世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織下達(dá)的工作;組織中心科研人員的知識(shí)產(chǎn)權(quán)法律、法規(guī)培訓(xùn);協(xié)助研究所知識(shí)產(chǎn)權(quán)主管行政部門審查、簽訂中心與國(guó)內(nèi)外研究、開(kāi)發(fā)機(jī)構(gòu)的知識(shí)產(chǎn)權(quán)合作協(xié)議和技術(shù)合作協(xié)議。
3.生物安全管理工作:制定實(shí)驗(yàn)室生物安全技術(shù)方案和實(shí)驗(yàn)室生物安全事故應(yīng)急預(yù)案;組織中心科研人員開(kāi)展實(shí)驗(yàn)室生物安全事件應(yīng)急知識(shí)和處理技術(shù)的培訓(xùn);評(píng)估、確定保藏部受理保藏微生物菌種的生物危害等級(jí);協(xié)助研究所生物安全主管行政部門組織實(shí)驗(yàn)室生物安全檢查,監(jiān)督實(shí)驗(yàn)廢棄物處理;發(fā)生實(shí)驗(yàn)室安全事件時(shí),負(fù)責(zé)向研究所主管部門報(bào)告,啟動(dòng)應(yīng)急預(yù)案,及時(shí)組織現(xiàn)場(chǎng)處置。
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